La elaboración del presente Atlas de ciliados y otros microorganismos frecuentes en sistemas de tratamiento de agua residuales, tiene como objetivo contribuir en la conformación de material didáctico útil para la enseñanza de la asignaturas Microbiología Ambiental I y II que se impartirán, de manera optativa, en el marco del nuevo programa de estudios de la carrera de Químico Farmacéutico Biológico. No obstante, también será de utilidad para aquellos alumnos que cursen la asignatura de Microbiología General II del plan de estudios actual. Asimismo, se considera que será un elemento de apoyo para la impartición de asignaturas similares que se ofrezcan en otras instituciones de educación superior y, en general, para aquellas personas interesadas en introducirse en este tema, como es el caso de operadores, supervisores y diseñadores de plantas de tratamiento de aguas residuales.